
דוברת המשרד מסרה כי "47,635 קבצים היו במצב לא מקוון לצורך בחינה נוספת, והם אמורים להיות מוכנים לפרסום מחדש עד סוף השבוע". הבדיקה הגיעה לאחר ניתוח של וול סטריט ג'ורנל ו-CBS, שמצאו כי מספר משמעותי של מסמכים לא הופיע בגל המסמכים שפורסם.
על פי הדיווחים, המסמכים כוללים טענות לא מאומתות לעבירות מין והתנהלות לא הולמת נגד אפשטיין, וכן אזכורים של הנשיא דונלד טראמפ. בין היתר מדובר בסיכומי ראיונות שקיימו סוכני ה-FBI בשנת 2019 עם אישה שטענה כי נפגעה מאפשטיין כשהייתה קטינה בשנות ה-80, וכי הוצגה לטראמפ על ידו. באחד המסמכים משנת 2025 צוין כי אותה אישה טענה שטראמפ תקף אותה באלימות כשהייתה בת 13 או 14 בניו ג'רזי.

עשרות אלפי מסמכים שנעדרו מגל החשיפה הקודם - יתפרסמו בימים הקרובים לציבור הרחב
טראמפ הכחיש שוב ושוב כל מעורבות פסולה, והבית הלבן מסר לקראת פרסום המסמכים כי "כפי שהנשיא טראמפ אמר, הוא זוכה לחלוטין מכל דבר שקשור לאפשטיין". בעבר טען טראמפ כי המסמכים שכבר פורסמו מזכים אותו מכל אחריות משפטית, מוסרית או אתית, והדגיש כי הקשר בינו לבין אפשטיין הסתיים סביב שנת 2004. לדבריו, עד למעצרו של אפשטיין ב-2019 לא שוחח עמו במשך כ-15 שנה.
המסמכים כוללים, בין השאר, סיכום ראיון ראשון עם אותה אישה שנערך ב-24 ביולי 2019, זמן קצר לאחר מעצרו של אפשטיין באשמת סחר מיני. בסיכום זה פורטו טענותיה לגבי פגיעה שחוותה באי הילטון הד שבדרום קרוליינה כשהייתה כבת 13, אך לא הוזכרו בו טענות כלפי טראמפ. בהמשך קיימו עמה החוקרים שלושה ראיונות נוספים באוגוסט ובאוקטובר 2019. סיכומי כל ארבעת הראיונות הועברו בשנת 2021 גם לעורכי דינה של גיליין מקסוול, והוגדרו כחומר של עדה שלא העידה בבית המשפט.
לפי גורמים המעורים בפרטים, אותה אישה הצטרפה גם לתביעה אזרחית נגד עיזבון אפשטיין וטענה כי הוטסה לניו יורק ונסחרה לגברים עשירים ובולטים. עם זאת, היא נמצאה לא זכאית לפיצוי במסגרת תוכנית הפיצויים לנפגעי אפשטיין, ששילמה הסדרים ליותר מ-130 קורבנות, ותביעתה נמחקה מרצונה בשנת 2021. ה-FBI מסר כי רבות מהטענות שנבדקו נמצאו כבלתי אמינות או שהוגשו ללא פרטי קשר.
סגן התובע הכללי טוד בלאנש, שפיקח על פרסום המסמכים, הדגיש בעבר כי המשרד פעל בהתאם לחוק ולא הסתיר חומרים בשל מבוכה אפשרית לנבחרי ציבור. במסיבת עיתונאים ב-30 בינואר אמר: "אני יכול להבטיח שעמדנו בדרישות החוק, שלא הגנו על הנשיא טראמפ. לא הגנו ולא מנענו הגנה מאף אחד". גורם נוסף במשרד המשפטים אמר כי "שום דבר לא נמחק", אך חברי קונגרס דמוקרטים בוועדת הפיקוח מתחו ביקורת על ההשחרות שבוצעו במסמכים.
חוק שקיפות מסמכי אפשטיין, שעליו חתם טראמפ בנובמבר, מחייב את משרד המשפטים לפרסם את רוב החומרים הקשורים לפרשות אפשטיין ומקסוול. החוק מתיר לעכב רק מסמכים כפולים, חומרים החוסים תחת חסיון עורך דין-לקוח, כאלה שעלולים לפגוע בחקירה מתנהלת או שאינם קשורים כלל לתיקים. הוא אף קובע במפורש כי אין לעכב או להשחיר מסמכים רק משום שהם עלולים להביך נבחרי ציבור.
לקראת הפרסום בינואר הפעיל משרד המשפטים מאות עורכי דין לבחינת המסמכים, במטרה לקבוע אילו חומרים חייבים בפרסום ואילו דורשים השחרה בהתאם לחוק. לפי הודעת המשרד, אם יתברר כי מסמך סווג בטעות ולא פורסם כנדרש, הוא יועלה בהתאם להוראות החוק. כעת, עם פרסום האצווה הנוספת הצפויה עד סוף השבוע, צפויים להתברר פרטים נוספים מתוך אחת הפרשות המתוקשרות בארצות הברית בשנים האחרונות.